Mikrobiologia, gleboznawstwo, jakość żywności i genetyka w rolnictwie (OBSIDIAN)

Głównym celem pola badawczego „Mikrobiologia, gleboznawstwo, jakość żywności i genetyka w rolnictwie” (OBSIDIAN) jest poznanie złożonych zależności zachodzących pomiędzy mikroorganizmami, roślinami i środowiskiem glebowym, które odpowiadają za produkcję i jakość pożywienia.

Kierownikiem zespołu EF jest prof. dr hab. Katarzyna Hrynkiewicz.

Działalność naukowa zespołu OBSIDIAN koncentruje się wokół:

• poznania bioróżnorodności mikroorganizmów środowiska glebowego i wpływu negatywnych czynników abiotycznych wywołanych zmieniającym się klimatem lub działalnością antropogeniczną;
• analizy mikroorganizmów towarzyszących roślinom (np. ryzosferowych i endofitycznych), które mogą w znaczącym stopniu stymulować wzrost roślin uprawnych oraz zwiększać ich tolerancję na niekorzystne warunki środowiskowe (np. susza, wysokie zasolenie gleb, niedobór składników pokarmowych);
• zrozumienia genetycznych podstaw interakcji zachodzących pomiędzy roślinami i endofitami oraz ich plastyczności fenotypowej;
• doskonalenia technologii stosowanych w produkcji żywności.

W efekcie przeprowadzonych badań naukowych powstaną nowe, unikalne bioprodukty, które znajdą zastosowanie w nowoczesnym rolnictwie oraz nowe technologie stosowane w produkcji żywności.

Pole badawcze jest przedsięwzięciem interdyscyplinarnym łączącym naukowców trzech Wydziałów Uniwersytetu Mikołaja Kopernika: Wydział Nauk Biologicznych i Weterynaryjnych (Katedra Mikrobiologii, Katedra Genetyki, Katedra Fizjologii Roślin i Biotechnologii), Wydział Chemii (Katedra Chemii Analitycznej i Spektroskopii Stosowanej) oraz Wydział Nauk o Ziemi i Gospodarki Przestrzennej (Katedra Gleboznawstwa i Kształtowania Krajobrazu). Priorytetowe zadania obejmują następujące obszary nauki: mikrobiologię, inżynierię rolniczą, roślinoznawstwo i fizjologię roślin, nauki o żywieniu i technologię żywności oraz gleboznawstwo. Naukową motywacją tego interdyscyplinarnego zespołu jest szeroko pojęta współpraca międzynarodowa oraz kształcenie młodej kadry otwartej na pracę w instytucjach naukowych oraz w sektorze prywatnym.

Prof. dr hab. Katarzyna Hrynkiewicz – kieruje Katedrą Mikrobiologii na Wydziale Nauk Biologicznych i Weterynaryjnych Uniwersytetu Mikołaja Kopernika. Główne zainteresowania badawcze prof. Hrynkiewicz dotyczą molekularnej analizy struktur mykoryzowych, zastosowania mikroorganizmów w procesach fitoremediacji gleb oraz wykorzystania mikroorganizmów endofitycznych w promowaniu wzrostu roślin uprawnych. W latach 2002-2004 odbyła dwuletni staż podoktorski (Marie Curie Fellowship) w Institute of Soil Science and Plant Nutrition (University of Rostock, Germany), podczas którego uczestniczyła w realizacji projektu “Molecular and biological characterization of ectomycorrhizal strains for phytoremediation”. W 2010 roku uzyskała stopień doktora habilitowanego na podstawie rozprawy pt. “The significance and performance of microorganisms associated with the rhizosphere of willows (Salix spp.) in unfavourable soil conditions“. Od wielu lat prowadzi współpracę z zagranicznymi ośrodkami naukowymi z Niemiec, Szwecji i Danii, np. University of Tübingen, University of Rostock, Leibniz-Institute of Vegetable and Ornamental Crop, Swedish University of Agricultural Sciences, gdzie realizowała liczne staże naukowe, np, DAAD, STSM. Prof. Hrynkiewicz była koordynatorem grantu finansowanego przez EU (Marie Curie Reintegration Grant), kierownikiem pięciu grantów finansowanych przez Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa Wyższego i Narodowe Centrum Nauki, opiekunem naukowym dwóch grantów PRELUDIUM oraz wykonawcą w licznych projektach realizowanych m.in. we współpracy międzynarodowej (np. ERA-NET, COST). W latach 2015-2019 była wykonawcą w projekcie „Boosting plant-Endophyte STability, compatibility and Performance Across ScaleS – BestPass” finansowanego w ramach projektu HORIZON2020 ikoordynatorem międzynarodowego zespołu badawczego WP1: Endophyte-plant compatibility. Prof. K. Hrynkiewicz prowadzi współpracę z firmami zagranicznymi zajmującymi się produkcją biopreparatów. Od 2019 r. jest Dyrektorem Interdyscyplinarnej Szkoły Doktorskiej Academia Copernicana.