W programie IDUB powołano 3 rady dziedzinowe pełniące funkcje opiniodawczo-doradcze oraz nadzorujące realizację zadań określonych w programie. Do zadań rad dziedzinowych należy w szczególności:
monitorowanie działalności naukowej zespołów badawczych w ramach wyłaniających się pól badawczych;
przygotowywanie listy rankingowej w konkursach na zespoły badawcze w ramach wyłaniających się pól badawczych;
przygotowywanie listy rankingowej w konkursach ogłaszanych dla zespołów badawczych w ramach wyłaniających się pól badawczych oraz ze środków na zrównoważenie rozwoju Uniwersytetu;
opiniowanie wniosków kierownika zespołu badawczego o włączenie pracownika Uniwersytetu do zespołu lub wyłączenie go z jego składu.
