Discovery, Diagnostics, Therapy for Healthcare (D2TH)

Celem projektu jest identyfikacja nowych biomarkerów prognostycznych i predykcyjnych poprzez integrację obrazów histopatologicznych, danych z sekwencjonowania nowej generacji (NGS) oraz informacji pochodzących z elektronicznej dokumentacji medycznej, takich jak dane o przebiegu leczenia i długości przeżycia. Zespół zastosuje zaawansowane algorytmy uczenia głębokiego do analizy tych różnorodnych danych, co umożliwi odkrycie istotnych wzorców molekularnych i morfologicznych związanych z przebiegiem choroby, rokowaniem i odpowiedzią na terapię…Pełen opis projektu

Oko ludzkie stanowi niezwykle złożony układ optyczny, zbudowany z wielu struktur i ośrodków o zróżnicowanych właściwościach fizycznych, optycznych i biologicznych. Jednym z kluczowych, a zarazem najsłabiej poznanych elementów jest ciało szkliste – galaretowata substancja wypełniająca wnętrze gałki ocznej, która objętościowo stanowi największą jej część i zalicza się do tylnego odcinka oka. Pomimo istotnej roli, jaką odgrywa w utrzymaniu prawidłowej architektury oka oraz w fizjologii i patologii siatkówki, jego struktura i funkcje pozostają nadal niedostatecznie rozpoznane…Pełen opis projektu

prof. dr hab. Tomasz Grzybowski

Zaburzenia składu i funkcji mikrobioty wpływają na procesy immunologiczne, zapalne, zakrzepowe, oddechowe i wiele innych. Celem projektu MICROFLORA jest wygenerowanie referencyjnych danych mikrobiomowych uwzględniających pochodzenie boiogeograficzne człowieka, a następnie wykorzystanie sztucznej inteligencji (AI) do opracowania spersonalizowanych protokołów terapeutycznych dostosowanych do profilu mikrobiomowego pacjentów kardiologicznych, dermatologicznych, pediatrycznych oraz neonatologicznych. Uzyskanie profili mikrobiomowych właściwych dla dorosłych pacjentów pomoże w optymalizacji terapii chorób zakrzepowych w kardiologii…Pełen opis projektu

Dlatego planujemy opracować rzetelnego biomarkera, który odpowiednio odzwierciedla jakość oocytu w odniesieniu do obecnego wieku biologicznego kobiet. Silna motywacja do wdrożenia tego projektu wynika nie tylko z oryginalności i nowatorskości, ale również z interdyscyplinarnego charakteru. Nasze badania łączą medycynę, genetykę, zootechnikę, biotechnologie i matematykę…Pełen opis projektu

prof. dr hab. Jacek Kubica
Nazwa zespołu badawczego: Integrative approach towards discovery, diagnostics, and therapy: from animal models to advancement in civilization diseases management

Głównym celem zespołu badawczego jest utworzenie na Uniwersytecie Mikołaja Kopernika interdyscyplinarnej międzynarodowej grupy badawczej D2T-CD (Discovery, Diagnostics, Therapy for Civilization Diseases – Odkrywanie, Diagnostyka, Terapia Chorób Cywilizacyjnych) w dziedzinach nauk biomedycznych, weterynaryjnych i nauk o zwierzętach. Nasz interdyscyplinarny zespół badawczy planuje współpracować z krajowymi i międzynarodowymi instytutami badawczymi oraz podmiotami z Polski, Unii Europejskiej, Stanów Zjednoczonych oraz Indii…Pełen opis projektu

prof. dr hab. Michał Marszałł
Nazwa zespołu badawczego: PBT – Pharmaceutical and Biomedical Team

Celem niniejszego projektu jest powołanie priorytetowego zespołu badawczego Uniwersytetu Mikołaja Kopernika w Toruniu, specjalizującego się w prowadzeniu zaawansowanych badań podstawowych i aplikacyjnych w obszarze nowoczesnych systemów dostarczania leków oraz innowacyjnych form farmaceutycznych. Rdzeń zespołu tworzą pracownicy Wydziału Farmaceutycznego Collegium Medicum UMK, współpracujący ściśle z ekspertami z Wydziału Chemii UMK – w zakresie projektowania i syntezy funkcjonalizowanych polimerów oraz zaawansowanych technik spektroskopowych (UV-Vis, IR, XRD, FTIR)…Pełen opis projektu

The overall principles of the project are: i) to capitalize on pre-trained foundational Large Language Models for Electronic Medical Records, biomedical imaging data, Omics, sequencing and other data modalities, while addressing domain specific classification and other data analysis and prediction tasks using fine tuning and related techniques; ii) to capitalize on the strengths of the multidisciplinary team of computer and data scientists as well as biomedical scientists and clinicians, while increasing horizontal integration between Collegium Medicum and informatics groups at NCU; iii) to leverage existing projects involving the use of AI and machine learning models in biomedicine, while developing transferable techniques, models and agents…Pełen opis projektu

dr hab. Karolina Mikulska-Rumińska, prof. UMK

BioEXPAND to interdyscyplinarny projekt badawczy, który łączy rozwój nowoczesnych narzędzi biofizyki obliczeniowej z ich praktycznym zastosowaniem w biomedycynie i biotechnologii. Obejmuje on zarówno tworzenie nowych metod analizy i wizualizacji zjawisk molekularnych (z wykorzystaniem uczenia maszynowego i grafiki komputerowej), jak i badania nad mechanizmami chorób oraz projektowaniem enzymów dla przemysłu. Projekt podejmuje także refleksję nad kulturowymi i politycznymi uwarunkowaniami rozwoju nowoczesnych technologii – ze szczególnym uwzględnieniem wpływu Chin na współczesną naukę…Pełen opis projektu

prof. Mauro Panteghini

Celem zespołu badawczego LFR jest opracowanie i ocena nowych algorytmów diagnostycznych, opartych na pośrednich rutynowych testach laboratoryjnych oceniających stopień włóknienia wątroby (np. ALT, AST, liczba płytek krwi) i bezpośrednich markerach włóknienia (składnikach macierzy pozakomórkowej) oznaczanych we krwi, w celu poprawy stratyfikacji ryzyka ALF…Pełen opis projektu

dr hab. Paweł Pomastowski, prof. UMK

Interdyscyplinarny Zespół powstały w ramach projektu NanoBioSPECTRA będzie miał na celu stworzenie innowacyjnej platformy łączącej trzy fundamentalne kierunki badawcze: (1) diagnostykę opartą na spektrometrii mas bazującej na laserowej desorpcji/jonizacji (LDI – MS) wspomaganej matrycą (MALDI), powierzchnią (SALDI) oraz nanostruktruami (NALDI), (2) integracyjne podejście do analizy interakcji na osi mikrobiom-gospodarz i ich znaczenia w procesach chorobotwórczych oraz (3) synteza i charakterystyka nanomateriałów o wysokim potencjale terapeutycznym oraz do zastosowań w żywności funkcjonalnej…Pełen opis projektu

dr Magdalena Wujak

PULMONeX-PRO to interdyscyplinarna inicjatywa badawcza ukierunkowana na opracowanie nowych strategii terapeutycznych w leczeniu chorób płuc i nowotworów. Projekt koncentruje się na białkach, które mogą stanowić: (a) cele modulacji farmakologicznej, np. za pomocą inhibitorów, aktywatorów, przeciwciał, (b) nośniki lub platformy w systemach dostarczania leków (np. białka rusztowania, przeciwciała, enzymy aktywujące proleki), (c) przedmiot inżynierii molekularnej – poprzez projektowanie i syntezę rekombinowanych białek terapeutycznych oraz ich immobilizację w celu poprawy stabilności i właściwości aplikacyjnych…Pełen opis projektu

prof. dr hab. Paweł Zalewski

Zespoły postinfekcyjne (PIS), takie jak zespół przewlekłego zmęczenia (ME/CFS) czy long-COVID, stanowią narastające wyzwanie dla systemów ochrony zdrowia, nie tylko ze względu na ich wysoką częstość występowania, ale również z powodu braku skutecznych metod diagnostycznych i terapeutycznych. PIS charakteryzują się złożoną symptomatologią (m.in. post-exertional malaise, zaburzenia funkcji poznawczych, dysautonomia), heterogennym przebiegiem oraz trudnością w jednoznacznym określeniu przyczyn biologicznych…Pełen opis projektu